Nous sommes à la fin du XIXème siècle. Le monde vit alors des heures sombres, et doit faire face à une nouvelle menace : d'étranges et meurtrières créatures, les Akumas, sèment chaos et désolation sur leur passage. Ils sont créés par le Comte Millénaire à partir de trois éléments : une âme, une tragédie et une machine ; liées ensemble par la Matière Noire. Agissant dans l'ombre, les Exorcistes, des « prêtres noirs » au service du Vatican combattent et détruisent ces monstres à l'aide d'une Innocence, et ce afin de rétablir la paix dans le monde et de préserver l'humanité. Mais leur tâche est ingrate : peu de personne connaissent leur existence, et de redoutables ennemis, bien plus dangereux que les akumas, se mettent en travers de leur chemin : Les descendants de Noé, des êtres surhumains aux pouvoirs étranges et souvent destructeurs. Qui sont réellement les Exorcistes ? Quelles sont les motivations du Comte Millénaire et du Clan de Noé ? Et quel pouvoir renferme ce « Cœur Précieux », que les deux camps s'arrachent depuis la nuit des temps ? Afin de le savoir, il faut prendre part au combat...